苗木运输需要进行包装的原因主要有以下几点：

保护根系：

苗木在运输过程中容易受到损伤，包装可以有效保护苗木的根系，避免根系在运输过程中受到进一步的损伤。

控制水分蒸腾：

苗木在运输过程中容易因风吹袭而失水，包装可以减缓水分的蒸发，保持苗木体内水分平衡，从而提高成活率。

维持水分代谢平衡：

通过包装，可以控制苗木在断根后的水分代谢，防止苗木在运输过程中过度蔫萎和死亡。

便于运输：

包装后的苗木更易于搬运和装载，提高了运输效率。

减少土球碎散：

对于需要带土球的苗木，包装可以防止土球在运输过程中碎散，减少根系水分的损失，提高存活率。

常用的包装材料包括草包、蒲包、聚乙烯袋、涂沥青不透水的麻袋和纸袋、集运箱等。包装方法可以采用机械包装或手工包装，具体方法包括将湿润物放在包装材料上，将苗木根对根放置，并在根间加些湿润物，或者将苗木的根部蘸满泥浆后卷成捆。

综上所述，苗木运输进行包装是为了保护根系、控制水分蒸腾、维持水分代谢平衡、便于运输以及减少土球碎散，从而确保苗木在运输过程中的成活率。